Вестник Кольского научного центра РАН. 2018, № 4.
Скрытые биомаркеры процессов минералообразования в генезисе уролитов характеризуются самыми низкими концентрациями глицина (4 -7 %). В фосфатных и оксалатных уролитах в единичных случаях установлено присутствие гидроксипролина, что указывает на возможное присутствие в их составе фибриллярных белков. Уратные мочевые камни (УМК). Изучено 8 образцов, которые по содержанию АК разбиваются на две группы — с высоким (29-33 мг/г образца) и низким (12-20 мг/г) содержанием. Установлено, что среди индивидуальных аминокислот доминирует глицин (9-36 %). По сравнению с другими типами камней здесь меньше глутаминовой (9-12 %) и аспарагиновой кислоты (5-14 %). В 3 образцах установлены высокие содержания тирозина (9-11 %). В связи с тем, что изученные типы уролитов невозможно отличить по содержанию и выделению доминирующих аминокислот, был проведен статистический анализ по относительным процентным содержаниям аминокислот одномерными (критерии Краскела — Уоллиса и Манна — Уитни) и многомерными методами («деревья классификации» и дискриминантный анализ) с использованием программного продукта Statistica 6.0. Критерием Краскела — Уоллиса установлено, что мочевые камни статистически значимо различаются по Gly, Ile, Asp, Glu, Lys ( p < 0,05). Для того чтобы установить, какие именно группы объектов различаются, был применен критерий Манна — Уитни. При попарном сравнении трех независимых групп образцов — мочекислых (уратных), фосфат- и оксалатсодержащих — использовался скорректированный критический уровень значимости, равный 0,017 [11]. Установлено, что по относительным содержаниям Gly и Glu фосфатные и оксалатные уролиты статистически значимо отличаются от мочекислых, но не различаются между собой. Содержание Asp статистически значимо различается только в УМК и ФСУ, но не различается для других пар мочевых камней. Поскольку УМК очень хорошо отличаются от ФСУ и ОСУ по Gly и Glu, то сравнение только этих двух типов уролитов (фосфат- и оксалатсодержащих) проводилось с заданным уровнем значимости 0,05. Установлено, что они различаются статистически значимо по Ile, Pro, Phe, Lys. Метод «деревья классификации» [12], проведенный по аминокислотному составу, показал 100 %-но правильную классификацию всех 28 образцов мочевых камней для всех типов ветвления, реализованных в программе Statistica 6.0 (дискриминантное одномерное ветвление для категориальных и порядковых предикторов, полный перебор для одномерных ветвлений по методу C&RT, дискриминантное ветвление по линейным комбинациям порядковых предикторов), с условием прекращения ветвлений — прямая остановка (FACT) и априорными вероятностями (0,67 — оксалатные, 0,22 — фосфатные, 0,11 — уратные), заданными с учетом исходных частот встречаемости разных типов уролитов у жителей Республики Коми. Самое простое и короткое дерево классификации, имеющее наименьшее число ошибок классификации в результате проведенной глобальной кросс-проверки, получено дискриминантным ветвлением по линейным комбинациям порядковых предикторов остановкой — прямая остановка (FACT). Граф дерева показан на рис. 3. Также для выявления статистически значимых различий аминокислотного состава образцов разных типов уролитов использовался традиционный метод — дискриминантный анализ [13]. В результате его применения установлено, что все три типа мочевых камней различаются по аминокислотному составу статистически значимо (статистика лямбда Уилкса 0,005 при уровне значимости p = 1,37Е-09). Для выявления информативных аминокислот, вносящих значимый вклад в различение образцов мочевых камней разных типов, был проведен дискриминантный анализ двумя методами — пошаговый с включением и пошаговый с исключением. Наибольшая доля правильной классификации образцов (100 %) была получена методом пошаговый с включением. С его помощью выявлено10 наиболее информативных аминокислот — Gly, Tyr, Lys, Leu, Ile, Ser, Thr, Phe, Glu, Pro. По этим аминокислотам были вычислены две канонические дискриминантные функции: первая дискриминантная функция очень хорошо различает оксалатные от других типов, но плохо — мочекислые и фосфатные уролиты. ВЕСТНИК Кольского научного центра РАН 4/2018 (10) 35
Made with FlippingBook
RkJQdWJsaXNoZXIy MTUzNzYz