Вестник МГТУ, 2023, Т. 26, № 3.

Мерзлякова Н. В. и др. Прогнозирование антимикробной активности пищевого пептида... в бочкообразных агрегатах, демонстрирующих водопроницаемые и трансмембранно ориентированные поры (Mink et al., 2021; Zhang et al., 2021). Рис. 3. Модель бочкообразных пор в мембране бактериальных клеток под действием антимикробных пептидов Fig. 3. A model o f barrel-shaped pores in the membrane of bacterial cells under the action o f antimicrobial peptides В последние годы поиск пептидных последовательностей с известными биологическими свойствами стал очень популярным, и соответствующие подходы постоянно разрабатываются. Авторами (Yan et al., 2022) представлены передовые вычислительные стратегии и выделены две группы исследовательских подходов: во-первых, открытие новых пептидов из встречающихся в природе последовательностей, во-вторых, разработка искусственных пептидов путем модификации известных или разработки de novo . Подход к открытию АМП предсказывает потенциальные пептиды путем виртуального скрининга больших библиотек известных пептидов, в частности, в поисках пептидов, которые структурно наиболее близки по последовательности к известным AMP. Следует отметить, что помимо положительного заряда и гидрофобности альфа-спиральные пептиды могут иметь различные аминокислотные последовательности, что приводит к усилению цитолитического и антибактериального эффектов (Pino-Angeles et al., 2016). В табл. 1 представлен аминокислотный состав последовательности пептида. Таблица 1. Аминокислотный состав последовательности пептида Table 1. Amino acid composition of the peptide sequence Наименование показателя аминокислотного состава последовательности пептида Аминокислотный состав Гидрофобная аминокислота I: 0 V: 0 L: 1 F: 0 C: 0 M: 0 A: 2 W: 0 Количество G и Р G: 0 P: 0 Отрицательно заряженная аминокислота E: 0 D: 0 Положительно заряженная аминокислота K: 2 R: 3 H: 0 Другая аминокислота T: 0 S: 1 Y: 0 Q: 0 N: 2 Анализ аминокислотной последовательности позволяет утверждать, что в пептиде содержатся 2 гидрофобные аминокислоты, которые обеспечивают ему высокий уровень гидрофобности и обусловливают антимикробную активность. Исследуемый нами пептид имеет аминокислотную последовательность KL, что свидетельствует о возможных противомикробных свойствах, так как вышеуказанная последовательность повторяется 5 раз в известном и испытанном антимикробном пептиде, состоящем из 18 аминокислот LKLLKKLLKKLKKLLKKL, разработанным и полученным синтетическим путем (Blondelle et al., 1992). Также подтверждением наличия антимикробной активности исследуемого пептида является то, что последовательность KL присутствует еще в одном известном пептиде Ac-LKLLKKLLKKLKKLLKKL-NH2, обладающем бактерицидным действием в отношении E. coli и P. aeruginosa (Yan et al., 2022), и в антимикробных пептидах G-A и G-G в отношении MCF7, A549, E. coli и С. aureus (Liu et al., 2022; Dean et al., 2020; Tucs, 2020). 236