Керт, Г. М. Загадки карельской топонимики : рассказ о географических названиях Карелии / Г. М. Керт, Н. Н. Мамонтова. - Электрон. дан. (1 файл: 31,4 МБ). - Петрозаводск : Карелия, 2008.

называется река у южных карел. Отсюда русское Шуя, где «я» - показатель женского рода по аналогии со словом «река» - возникло уже на русской почве. Некоторые ученые полагают, что топоним Шуя возник из Suojoki под влиянием давно известных русских «Шуй». Финский ученый Я.Калима, однако, считал, что данное название не прибалтийско-финское, а славянского или же мерянского происхождения (как и Шуньга, Шокша, Шелтозеро, Суна и т.д.).